Keido libera Segai de seus serviços, dando-lhe dados contendo informações sobre os vazios, como prometido, antes de ir para a torre de cristal. Enquanto isso, Gai diz a Shu para seguir Yu, que ajuda Shu a recuperar suas memórias. Quando ele era mais jovem, Shu e sua irmã mais velha, Mana Ouma, morando em uma ilha em Oshima, avistaram Gai na praia. Gai passou o verão com eles em sua casa de praia, tornando-se o melhor amigo de Shu enquanto se apaixonava por Mana. Depois de experimentar o flashback, Shu se encontra na torre de cristal, onde Keido tem Inori ligado. Keido explica que Inori foi criado para ressuscitar Mana, cuja alma está preservada graças ao vírus, a fim de espalhar o vírus para aniquilar a raça humana, e ele pretende criar uma nova raça ao se casar com Mana Ouma. Enquanto Yu prepara uma cerimônia, outro flashback revela que Mana disse a Shu que ela queria se casar com ele. No entanto, Gai depois soube que ela estava infectada com o vírus Apocalypse, que induziu sua insanidade, mas Mana ameaçou-o para não contar a Shu. De volta ao presente, Shu tenta parar a cerimônia, apenas para ser ligado por plantas de cristal controladas por Mana. Gai e Ayase chegam na torre para revidar, mas o Endlave Steiner de Ayase é destruído no processo. O último flashback revela que Gai pediu a Shu para encontrá-lo em uma igreja para lhe contar a verdade sobre Mana, mas Mana veio e enganou Gai para que ele atirasse em si mesmo com uma arma defeituosa. Shu foi perturbado por isso em sua chegada, em seguida, rejeitou a se casar com ela, o que a levou a enlouquecer e espalhar o vírus do Apocalipse por toda Tóquio, acabando por se destruir de seu próprio poder por medo. Como resultado, Gai prometeu ficar mais forte, já que ele era responsável por isso, enquanto Shu reprimia suas memórias sobre Mana e Gai devido ao trauma. Shu, que finalmente se lembra do seu passado, extrai Gai's Void, uma arma que força os Vazios de outras pessoas, e vai resgatar Inori enquanto Gai se dirige para o casulo para libertar a alma de Mana. Keido tenta pará-los, mas Yu o expulsa por não se casar. Gai alcança o casulo, mas é perfurado pelos cristais que o protegem. Shu não tem escolha senão esfaquear Gai através de seu corpo com o Vazio de Inori para destruir o casulo. Quando a torre desmorona, Gai finalmente segura Mana em seus braços e eles desaparecem juntos, enquanto Shu e Inori flutuam em segurança e lamentam sua morte.